1946年5月,国民党的党、政、军、中央机关及各党派团体的全国性领导机构纷纷迁往南京。随着国民党统治区政治中心的转移,周恩来、董必武也先后率领中共代表团和秘密的中共南方局工作人员一起转往南京。中央南方局迁南京后,便改称为"中共中央南京局"。在陪都重庆坚守八年之久的南方局就此谢幕。
重庆谈判已过去了半个多世纪,中共南方局到底是如何获取蒋介石谈判的底牌,到现在仍是迷雾重重。也许,这永远是一个谜。