下午两点八分，清军小炮舰福胜号从罗星塔处偷袭法鉴后方但皆未击中目标，随即被法舰迪盖-吐安号击沉。两点二十五分，被猛烈炮击的马尾船政局船坞因附近埋藏地雷被击中而炸毁，里头停泊的三艘单桅船漂出港外，其中一艘撞到罗星塔附近沙洲上的火药库，引发大爆炸，造成搭乘木船作战的清军死伤惨重，而附近十二艘战舰试图前来支援，却纷纷遭法舰炮击，无法突破。下午五点左右，福建水师几乎全灭，而陆上的各炮台也在法舰强大火力下纷纷失守，于是清军派数艘载满燃料的戎克船冲撞法舰，但全被法军击沉。至此清军水师已无反击之力，而清军主帅张佩纶与何如璋则早在开战不久便弃舰逃跑。
8月24日至26日，法军舰队开始攻击田螺湾与闽安沿岸的清军炮台，群龙无首的守军见法舰后纷纷弃守，不战而逃。8月26日，孤拔率领8艘军舰停泊馆头，炮轰金牌炮台和长门炮台，前者遭法舰击毁，后者曾以哈乞开斯机关炮反击，但却遭到法军陆战队袭击，随后遭法舰迪盖-吐安号摧毁。
