杨涟在奏疏中列举了魏忠贤的二十四条罪状，揭露他迫害先帝旧臣、干预朝政，逼死后宫贤妃，操纵东厂滥施淫威等罪行，最后指出魏忠贤专权的恶果是"致掖廷之中，但知有忠贤，不知有陛下；都城之内，亦但知有忠贤，不知有陛下"。请求朱由校"大奋雷霆，集文武勋戚，敕刑部严讯，以正国法！
魏忠贤看到非常生气，想出了对策，因为朱由校是个不识字的皇帝，所以让读奏章的太监，故意将杨涟奏本中的关键性辞句省略，把一篇慷慨激昂的奏章读成荒诞不经的谬文，反正朱由校又看不懂，使得朱由校越听越气。此外在小太监读奏章的时候，魏忠贤还哭哭滴滴的说自己冤枉冤枉的，让朱由校居然安慰起魏忠贤来了！此后魏忠贤也就跟没事人一样
但是检举魏忠贤的杨涟可就惨了，魏忠贤对杨涟恨之入骨。同年十月，魏忠贤矫旨责杨涟"大不敬"、"无人臣礼"。将杨涟革职为民，后来魏忠贤捏造证据诬害杨涟等人为熊廷弼脱罪，向主审官受贿四万两白银。为此大张旗鼓的逮捕杨涟、左光斗、魏大中等十七名东林党人。
