他当上教皇的最终目的是自己以及整个家族能够得到最大的权益。在当上教皇之后，他就开始斡旋于那不勒斯与法国之间的矛盾，搞得法国查理八世攻打罗马，亚历山大六世立刻把奥斯曼等国拉下水，随后把自己私生子恺撒给抵押出去。接着，亚历山大六世参与了西班牙，葡萄牙两国分世界的重要事件，在1494年6月7日，亚历山大六世把西经46°37'的南北经线定位西班牙与葡萄牙的势力分界线：以西归西班牙，以东归葡萄牙，这条线，在历史上被称为"教皇子午线"。
教皇子午线
亚历山大六世除了在西方殖民规划中起了重要的作用，还在自己的重要神职人员架构上玩弄权术，不仅毒杀神职人员，将主教杀了后，疯狂搜刮别人的遗产，随后安排出钱的人去就职，来来回回搞了几批，除了自己私生子没毒杀之外，几乎都来了一遍。
