ZTZ-99一期改型（部分网友称之为99G式）：加装反应-4反应装甲后的早期型。炮塔正面为斜线纹理。加装了战场信息化系统和激光对抗装置。
ZTZ-99二期改型（部分网友称之为99A1式）：99的改进型，改良了炮塔结构，增强车体装甲，反应装甲换成反应-5，125毫米火炮，加装了战场信息化系统和激光对抗装置。
ZTZ-99三期改型，官方定名99式A型（部分网友称之为三代大改或99A2式）：是在99式基础上重新研发的升级型号，重设计炮塔以及底盘悬挂设备，更换1500马力发动机和数字化光电设备、新型激光反制武器，而炮塔正面主装甲块及附加装甲相加后获得的物理厚度达到极高的水平，是一种面对高强度反坦克战场环境型号。
未知型号（部分网友称之为99式轻型坦克）：使用三代炮塔技术的新主力轻型坦克，装备长管105mm滑膛炮，采用6对负重轮，全重约30吨，未完全公开，部署于青藏高原，也许后期将会部署于南方地区以替代老式62式轻型坦克。
