在当时敌我双方生死搏斗的关键时刻，解甲归田，洁身引退的路也是难以走通的，他只好把希望寄托于"唯其妖灭尽，予志复归林"。至于叛变投敌更不是他能干出来的事情，最后只好率军远征，作为解决矛盾的手段。他认为，只有这样才可以避免另一次内部残杀，以保存革命力量，还可以另辟根据地，剿除妖魔，开疆报国，这实在是石达开这个农民英雄在无力解决内部矛盾的情况下，被迫选择的惟一出路。
对石达开的出走，因限于资料，说法甚多，至今仍是一个难解的千古之谜。
一种说法认为，石达开不顾大局，私自离京搞分裂活动，是另树一帜，另立"太平安国"。石达开的出走引起了清王朝的关注，清廷驻安徽的头目四出侦察打听石达开的动向，并及时向清廷汇报。他们认为石达开"意欲自成一队"，"似欲另立旗帜"。咸丰七年(1857)七月十一日，《福兴奏据探石达开另树一帜江右吃重请增兵协剿片》中有"现据探称，该逆自与洪逆内江后，据守安庆，潜于金柱关等处粘贴伪示，解散金陵旧党，愿从军者即赴安庆，不愿者给川资剃发回籍，示尾署太平安国丁巳元年字样，其为另树一帜，已无疑义。"
苏州博物馆藏有咸丰七年(1857)六月二十八日两江总督何桂清致自娱主人书中，有洪秀全"在金陵惊慌无比，求石逆回救，不惟不允，且回文改号太平安国丁巳元年。"与以上福兴奏中"示尾署太平安国丁巳元年"一致，这说明石达开另立"太平安国"说并非孤证。
