现代防空体系中的雷达系统要与己方飞机协同作战，因而需要共享大量信息。但如果生产雷达和飞机的国家不在同一阵营，那就麻烦了。美国军方高层一再警告，土耳其购买俄罗斯S-400防空系统可能危及F-35战斗机。但他们没有透露更详细的原因。
6月份的时候，美国欧洲司令部司令、北约最高盟军欧洲指挥官托德·沃尔特尔斯上将曾解释说：“不能在S-400附近飞F-35。S-400和F-35互相之间不能技术联通。S-400和F-35是两个系统， 当然是S-400对抗F-35，试图探究F-35的能力。无论是从雷达的角度，还是从作战的角度，我们对与俄罗斯分享F-35的能力不感兴趣。我们已经说得非常、非常清楚了。”
老乌鸦协会（编者注：美国电子战协会）理事会成员、伦敦城市大学大卫·斯图普斯教授指出，S-400的雷达将能够“对F-35所有飞行剖面进行观察，从而识别出其隐身能力中的弱点”。
土耳其S-400合同中含有俄罗斯5年的技术支持，这将给俄罗斯充足的机会，将情报人员安置在导弹连和操作人员中。他说，这种情况在印度非常常见，印度也是S-400的另一个客户。
斯图普斯还担心， 如果土耳其将S-400与北约防空地面环境（NADGE）集成在一起，会发生什么？北约防空地面环境包括大量雷达和其他传感器，目标瞄准系统， 通信链路，敌友识别系统等。S-400技术支持体系中安插的相关“技术人员”可以轻易获取F-35的能力指标。
俄罗斯政府对向北约国家出售S-400却没有类似的担忧。部分原因也因为俄罗斯向土耳其出售的S-400是出口型，与俄罗斯使用的版本会有不同。
