红旗-16防空导弹具备很强的多目标攻击能力，一个火力发射单元可以同时跟踪8个目标，并对其中4个进行攻击。
而它可以攻击的目标种类众多，从高空飞行的飞机到低空飞行的巡航导弹，甚至是飞机投掷的精确制导武器，红旗-16防空导弹都能够有效对抗。在很大程度上，红旗-16防空导弹还能够对抗敌方空中力量发动的“野鼬鼠”防空压制攻击。
