第二个挑战是如何将这些系统与现有的反潜平台集成在一起，以及如何让它们之间实现相互协作和共享信息。第三个挑战是如何使无人驾驶系统变得"聪明"。因为水下环境远比地面和空中更为复杂，无人反潜装备需要从周围环境中自主学习、规划和协作，组建无人系统集群来承担反潜任务。
而最后一项挑战是开发能最大程度自由使用无人系统的工程解决方案，其中包括开发使无人反潜系统达到最大速度和续航力的能源解决方案;如何在恶劣的天气释放和回收;如何通过新一代水下导航技术来提高跟踪和指示目标潜艇的精度;以及无人反潜设备长期部署时面临的运行稳定性问题。
